Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL9A3Q14050 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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