Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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DDX39BQ13838 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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DDX39BQ13838 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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DDX39BQ13838 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DDX39BQ13838 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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