Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCOA4Q13772 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms