Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NAE1Q13564 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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