Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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AP3B2Q13367 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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AP3B2Q13367 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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