Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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