Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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TRAF1Q13077 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF1Q13077 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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