Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNIP1Q12981 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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