Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDH17Q12864 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH17Q12864 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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