Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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ARHGEF5Q12774 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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ARHGEF5Q12774 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGEF5Q12774 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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