Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms