Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms