Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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FAM27E3Q08E93 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM27E3Q08E93 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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