Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms