Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB2Q08289 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNB2Q08289 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms