Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CHRNEQ04844 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms