Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1Q04771 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms