Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EMX2Q04743 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms