Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERCC6Q03468 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERCC6Q03468 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms