Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CENPEQ02224 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms