Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DEFA6Q01524 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DEFA6Q01524 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms