Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCQ00610 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCQ00610 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms