Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXC5Q00444 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms