Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms