Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
HBBP68871 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HBBP68871 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
HBBP68871 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HBBP68871 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
HBBP68871 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HBBP68871 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms