Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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