Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP3P54852 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP3P54852 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP3P54852 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP3P54852 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms