Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR5P51681 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR5P51681 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCR5P51681 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms