Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ALDH9A1P49189 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms