Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms