Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPOP42166 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms