Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARL1P40616 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms