Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA9P31269 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA9P31269 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms