Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms