Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PLNP26678 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PLNP26678 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms