Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms