Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGS1P23219 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms