Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF1P22415 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF1P22415 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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