Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCNA2P20248 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCNA2P20248 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms