Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCNAP12004 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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