Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC192P0DO97 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms