Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC175P0C221 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms