Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTCP00480 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTCP00480 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTCP00480 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTCP00480 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms