Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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ZBED1O96006 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZBED1O96006 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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