Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAPLNO95428 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms