Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PPFIA3O75145 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms