Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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