Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC11O43248 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms