Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FABP7O15540 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FABP7O15540 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FABP7O15540 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FABP7O15540 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FABP7O15540 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms