Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM38O00635 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM38O00635 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms